Алексин впервые упомянут в Никоновской летописи в 1348 году. Тогда ордынский хан Темир совершил опустошительный набег и пожёг его. Поселение на этом месте было основано гораздо раньше, но точных данных об этом нет. В 1361 году войска литовского князя Ольгерда снова разорили город. В 1392 году Алексин перешел под власть Московского князя Василия I и стал важной порубежной крепостью Московского государства. В 1472 году город героически оборонялся при нашествии ордынского хана Ахмата. Крепость не в первый раз была сожжена, и вскоре возродилась на новом месте, где и сейчас расположен город.
В 16-м веке Алексин также подвергался многочисленным нападениям крымских ханов, а в Смутное время алексинцы перешли на сторону Лжедмитрия I, а затем Ивана Болотникова. В 1607 году правительственные войска царя Василия Шуйского взяли крепость, и с той поры его жители служили законным государям и участвовали в изгнании польских интервентов с русской земли. После воцарения династии Романовых границы государства отошли далеко на юг. Город зажил относительно мирной жизнью, но на него обрушились другие напасти. В 1654 году эпидемия «чёрной смерти» унесла большую часть населения, в 1656-м был сильнейший пожар. К концу века развивается кузнечное дело, появляется первый доменный завод. В 1688 году построено первое каменное здание города — Старый Успенский собор.
В 1708 году Алексин вошёл в состав Московской губернии. В 1768 году императрица Екатерина II утвердила регулярный план застройки города, в 1777 году стал уездным городом Тульской губернии. В 19 веке Алексин стал центром лесопильной и металлургической промышленности. В 1813 году освящен Новый Успенский собор. В городе открываются гимназии, земские учреждения, городской банк. В окрестностях обнаружены залежи каменного угля.
Советская власть установилась в городе в январе 1918 года. В 1937 году он вошёл в состав Тульской области. С 29 ноября по 17 декабря 1941 года был оккупирован немецкими войсками, освобождён частями 238 стрелковой дивизии. После войны были построены промышленные предприятия, открыты учреждения культуры, построены школы, профессиональные училища и техникумы, жилые микрорайоны.
Алексин представляет интерес и для туриста. Краеведческий музей расположен в старинном купеческом особняке купца Маслова. Никольский храм построен ещё в конце 18 века. Город расположен на берегу живописной реки Оки. Здесь можно увидеть хорошие виды на её долину, провести время на берегу Оки в летнее время.