Первое упоминание о поселении в этом месте датируется 1382 годом. В 15 веке назывался Никольский Пудожский погост. Статус города получил в 1785 году по указу императрицы Екатерины. В течении 19 века здесь развивалась промышленность, действовали стекольные и лесопильные заводы. Советская власть установилась в 1918 году, с 1923 года город в составе Карельской ССР.
В городе сохранилась историческая деревянная застройка конца 19 века начала 20 века, очень хороший историко-краеведческий музей. В Пудожском районе очень много красивых природных мест — Бесов нос с петроглифами, река Водла, великолепные берега Онежского озера. Любой район Карелии прекрасен своей природой, городские достопримечательности здесь менее важны.
