Вагатозеро расположено в Пряжском районе Карелии. Чтобы попасть на озеро, нужно свернуть с трассы А-121 и ехать в сторону п.Эссойла. По дороге встретится деревня Нижняя Салма. Через неё проще всего подъехать к озеру. Вся остальная часть берега необитаема и труднодоступна.
Озеро имеет внушительные размеры 6,5 на 5 километров, береговая линия составляет 22 км. В принципе озеро это сильно расширенное русло реки Шуя, которая протекает через него и соединяет с Шотозером. Есть и другие притоки, например река Сяпся. Максимальная глубина 8,5 метра, но в основном озеро мелководно, чуть более 2 метров. Вода очень хорошо прогревается летом, в отличие от многих карельских озер. Прозрачность тоже хорошая. В озере обитает 18 видов рыбы, особенно много леща и плотвы. Берега покрыты лесом, вдоль них растут камыш, осока,тростник. Много песчаных участков. Ещё одно великолепное карельское озеро.